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G09势能面扫描问题

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发布时间: 2017-3-27 22:44

正文摘要:

老师好,这是我用g09做柔性势能面扫描的曲线图,通过扫描键长减少距离来实现的,想问下最后出现几个断点是怎么回事?是我的结构不好吗?发现断点前后结构发生了发生扭动,谢谢各位老师的指点。

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XZDZ 发表于 Post on 2017-11-23 18:48:58
shengyuhu 发表于 2017-3-28 10:25
谢谢老师,是的,我查看断点前后结构发生了突变,那老师,我做PES想看扫描前后的能垒,是用柔性扫还是刚 ...

您好,我也遇到了和您同样的问题,我想请问一下,断点前后的结构突变代表着什么呢?有啥物理意义啊?谢谢了
XZDZ 发表于 Post on 2017-11-22 14:49:21
sobereva 发表于 2017-3-27 23:18
是柔性扫描常见现象,注意观看断点前后结构,应当有几何结构的突变。
柔性扫描每一步都是限制性优化,所以 ...

sob老师,我在做过渡态结构的柔性扫描,扫描二面角的时候,也遇到了同样的问题,并且断点前后结构确实也有一个较大的扭动,但是断点的那两个点,四个收敛条件又是"yes",我不懂这个是什么原因造成的,所以想请教一下老师,谢谢
shengyuhu 发表于 Post on 2017-3-29 12:28:08
sobereva 发表于 2017-3-28 23:34
怎么做看你研究什么,是增长和减小没有哪种一定更合适的说法

嗯嗯,好的,谢谢老师的耐心解答。
sobereva 发表于 Post on 2017-3-28 23:34:21
shengyuhu 发表于 2017-3-28 12:06
嗯嗯,老师,那通过改变键长来扫描的话,是增加距离比较合理还是减少距离好呢?还是说都可以的,我看有篇 ...

怎么做看你研究什么,是增长和减小没有哪种一定更合适的说法
shengyuhu 发表于 Post on 2017-3-28 12:06:50
sobereva 发表于 2017-3-28 10:29
用柔性的。刚性的缺乏化学意义
柔性扫描时候其它变量有滞后效应,观看结构判断

嗯嗯,老师,那通过改变键长来扫描的话,是增加距离比较合理还是减少距离好呢?还是说都可以的,我看有篇文献中是通过减少距离来扫描的,上图中的曲线,我尝试了一个增加距离来扫描,发现能量一直升高。。
sobereva 发表于 Post on 2017-3-28 10:29:19
shengyuhu 发表于 2017-3-28 10:25
谢谢老师,是的,我查看断点前后结构发生了突变,那老师,我做PES想看扫描前后的能垒,是用柔性扫还是刚 ...


用柔性的。刚性的缺乏化学意义
柔性扫描时候其它变量有滞后效应,观看结构判断
shengyuhu 发表于 Post on 2017-3-28 10:25:10
sobereva 发表于 2017-3-27 23:18
是柔性扫描常见现象,注意观看断点前后结构,应当有几何结构的突变。
柔性扫描每一步都是限制性优化,所以 ...

谢谢老师,是的,我查看断点前后结构发生了突变,那老师,我做PES想看扫描前后的能垒,是用柔性扫还是刚性的?还有就是减少键长进行柔性扫描时会出现这样一个能垒,但是增加键长扫描时能量一直升高,没有能垒出现,为什么反过来扫描趋势就不一样了呢?
sobereva 发表于 Post on 2017-3-27 23:18:08
是柔性扫描常见现象,注意观看断点前后结构,应当有几何结构的突变。
柔性扫描每一步都是限制性优化,所以往往在被扫描的变量越过某一个点后,其余变量优化的方向就朝着和之前一步完全不同的方向去了,显然能量也会突跃。所以突跃是有物理意义的,不代表不合理,而是应当正确理解其原因。

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