shengyuhu 发表于 2017-3-28 10:25 您好,我也遇到了和您同样的问题,我想请问一下,断点前后的结构突变代表着什么呢?有啥物理意义啊?谢谢了 |
sobereva 发表于 2017-3-27 23:18 sob老师,我在做过渡态结构的柔性扫描,扫描二面角的时候,也遇到了同样的问题,并且断点前后结构确实也有一个较大的扭动,但是断点的那两个点,四个收敛条件又是"yes",我不懂这个是什么原因造成的,所以想请教一下老师,谢谢 |
sobereva 发表于 2017-3-28 23:34 嗯嗯,好的,谢谢老师的耐心解答。 |
shengyuhu 发表于 2017-3-28 12:06 怎么做看你研究什么,是增长和减小没有哪种一定更合适的说法 |
sobereva 发表于 2017-3-28 10:29 嗯嗯,老师,那通过改变键长来扫描的话,是增加距离比较合理还是减少距离好呢?还是说都可以的,我看有篇文献中是通过减少距离来扫描的,上图中的曲线,我尝试了一个增加距离来扫描,发现能量一直升高。。 |
shengyuhu 发表于 2017-3-28 10:25 用柔性的。刚性的缺乏化学意义 柔性扫描时候其它变量有滞后效应,观看结构判断 |
sobereva 发表于 2017-3-27 23:18 谢谢老师,是的,我查看断点前后结构发生了突变,那老师,我做PES想看扫描前后的能垒,是用柔性扫还是刚性的?还有就是减少键长进行柔性扫描时会出现这样一个能垒,但是增加键长扫描时能量一直升高,没有能垒出现,为什么反过来扫描趋势就不一样了呢? |
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是柔性扫描常见现象,注意观看断点前后结构,应当有几何结构的突变。 柔性扫描每一步都是限制性优化,所以往往在被扫描的变量越过某一个点后,其余变量优化的方向就朝着和之前一步完全不同的方向去了,显然能量也会突跃。所以突跃是有物理意义的,不代表不合理,而是应当正确理解其原因。 |
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