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请教，TiC周期性体系npt正常，md模拟后盒子散架

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Eianghuan

发布时间: 2025-6-21 12:31

正文摘要:

本帖最后由 Eianghuan 于 2025-6-21 12:35 编辑请教各位老师，我在对含有壳聚糖，水分子和TiC片层的盒子进行模拟的时候发现，轨迹中盒子散架，如下图：所使用的mdp文件为附件md_PBC.mdp 在进行NVT和NPT时，盒 ...

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Eianghuan 发表于 Post on 2025-6-22 20:44:11

sobereva 发表于 2025-6-22 08:16
NVT/NPT和md完全不是并列的关系，本来NVT、NPT就是MD用的不同的系综。提问时不要用奇怪、令人费解的描述。 ...

收到，谢谢sobereva老师指正，我去学习一下帖子

sobereva 发表于 Post on 2025-6-22 08:16:56

NVT/NPT和md完全不是并列的关系，本来NVT、NPT就是MD用的不同的系综。提问时不要用奇怪、令人费解的描述。注意看下文“不要迷惑性地描述分子动力学研究过程”部分
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298（http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html）

既然之前的动力学都能正常跑，把mdp设置每改一次跑一次，反复测试自然能找到原因

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