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acpype运行报错咨询

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一生予安

发布时间: 2025-7-2 19:34

正文摘要:

使用acpype做小分子重复单元拓扑的生成，报错结果为如下：/home/hui/miniconda3/bin/acpype:339: SyntaxWarning: invalid escape sequence '\.' verNum = re.sub('[^0-9\.]', '', sys.version.split()[ ...

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一生予安 发表于 Post on 2025-7-3 08:40:23

sobereva 发表于 2025-7-3 02:48
直接用sobtop（http://sobereva.com/soft/Sobtop）产生拓扑文件就完了，最省事，比acpype强大灵活得多，完 ...

好的老师

sobereva 发表于 Post on 2025-7-3 02:48:43

直接用sobtop（http://sobereva.com/soft/Sobtop）产生拓扑文件就完了，最省事，比acpype强大灵活得多，完全取代acpype，还用不着Python运行环境、用不着装臃肿的AmberTools。有了sobtop后acpype就没什么存在意义了

一生予安 发表于 Post on 2025-7-2 22:04:24

student0618 发表于 2025-7-2 21:44
怎么安装的？Antechamber放在哪？

使用的conda install -c conda-forge ambertools安装时有看到antechamber，然后放在哪刚没找到，这是不是就是没设置环境变量的位置

一生予安 发表于 Post on 2025-7-2 21:58:43

我下载ambertools的网址使用conda install -c conda-forge ambertools这个代码安装有看到antechamber，但现在我没找到这个antechamber，是环境没设置啊

student0618 发表于 Post on 2025-7-2 21:44:31

怎么安装的？Antechamber放在哪？

一生予安 发表于 Post on 2025-7-2 21:37:46

我的理解是缺乏设置的环境变量

一生予安 发表于 Post on 2025-7-2 21:05:57

不好意思，刚接触这个，说是解决环境的懒人脚本，，这个是解决了下面的问题，上面的问题是也可以解决吗？

18217265596 发表于 Post on 2025-7-2 21:04:28

ERROR: no 'antechamber' executable!试着理解这句话的意思。

风起~ 发表于 Post on 2025-7-2 20:38:17

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