在用生成小分子拓扑文件时报错

查看数: 324 | 评论数: 3 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2025-7-5 17:31

本帖最后由 weifang 于 2025-7-5 17:33 编辑各位老师好！我在使用gromacs生成小分子的拓扑文件时报错，不知道怎么解决，希望有老师可以解答一下

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2025-7-9 02:46:38

weifang 发表于 2025-7-7 15:37
好的，sob老师，用sobtop可以生成淀粉直链片段这种多糖的拓扑吗

也不是不能，用GAFF力场也可以当普通有机分子处理，但终究不如用专用的糖力场理想

weifang 发表于 Post on 2025-7-7 15:37:09

sobereva 发表于 2025-7-6 08:22
用sobtop产生拓扑文件是十分主流、我最推荐的做法，仔细看http://sobereva.com/soft/Sobtop
很不推荐新人 ...

好的，sob老师，用sobtop可以生成淀粉直链片段这种多糖的拓扑吗

sobereva 发表于 Post on 2025-7-6 08:22:55

用sobtop产生拓扑文件是十分主流、我最推荐的做法，仔细看http://sobereva.com/soft/Sobtop
很不推荐新人看某些写得不理想的教程用一些偏门、过时、近乎无人问津的做法。

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register