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求助葫芦脲与客体分子吸附问题的泛函基组推荐

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发布时间: 2025-7-8 22:27

正文摘要:

各位老师好,我最近在做葫芦脲与客体分子吸附问题,体系总共有160个分子左右,主要计算主客体间的弱相互作用,主客体分子仅涉及C、N、O、H、S这些元素,通过查阅文献打算采用wB97XD/6-311G**做结构优化及电子能量( ...

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DFT.. 发表于 Post on 2025-7-9 14:32:00
Stardust0831 发表于 2025-7-8 22:46
结构优化3zeta有点太大了,用wB97XD/6-31G**通常够用。《浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组》
如果 ...

感谢老师回复!
DFT.. 发表于 Post on 2025-7-9 14:31:38
sobereva 发表于 2025-7-9 05:02
如果要算弱相互作用能,6-311G**结合counterpoise也不够用,应当用6-311+G(2d,p)结合counterpoise。可参考 ...

感谢老师回复!
sobereva 发表于 Post on 2025-7-9 05:02:10
如果要算弱相互作用能,6-311G**结合counterpoise也不够用,应当用6-311+G(2d,p)结合counterpoise。可参考下文表格里不同基组计算弱相互作用能误差的对比
使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html
Stardust0831 发表于 Post on 2025-7-8 22:46:07
本帖最后由 Stardust0831 于 2025-7-8 22:50 编辑

结构优化3zeta有点太大了,用wB97XD/6-31G**通常够用。浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组
如果目的是计算弱相互作用,可以考虑在wB97XD/6-31G**优化得到的基础上,用M06-2X/6-311G**算单点,记得考虑BSSE:《谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理》

我个人更推荐用ORCA的gCP来处理BSSE问题,gCP有解析梯度和hessian,基本上不会增加很多耗时。
如果换ORCA,我推荐RI-wB97M-V/def2-TZVP//RI-B3LYP-D3(BJ)/def2-SVP ,并且记得带上gCP

以ORCA 6.1.0为例,关键词可以是:
预优化:
  1. !XTB2 opt
复制代码

结构优化:
  1. ! B3LYP D3 def2-SVP gCP(DFT/SVP) def2/J RIJCOSX tightopt freq verytightSCF noautostart miniprint defgrid3
复制代码

单点:
  1. ! wB97M-V def2-TZVP gCP(DFT/TZ) def2/J RIJCOSX verytightSCF noautostart miniprint defgrid3
复制代码


吉布斯自由能之类的热力学数据推荐用shermo:《使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据

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