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pdb2gmx中因原子在力场拓扑模板条目未找到，导致拓扑生成失败如何解决

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lllllt

发布时间: 2025-7-9 16:30

正文摘要:

本帖最后由 lllllt 于 2025-7-9 16:32 编辑 Fatal error: Atom P in residue U 1187 was not found in rtp entry RU5 with 28 atoms while sorting atoms. 已经试着使用 pdb4amber 或 pdbfixer[自动修正原子 ...

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lllllt 发表于 Post on 2025-7-11 10:16:55

sobereva 发表于 2025-7-9 21:26
弄清楚你截图的部分是不是报错提示对应的那个残基

应该是吧就是这个U

sobereva 发表于 Post on 2025-7-9 21:26:08

弄清楚你截图的部分是不是报错提示对应的那个残基

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