Aletyx 发表于 2025-7-17 01:12 明白了 感谢大佬解惑 刚开始接触MS 用的比较少 |
1. 对于孔道内吸附这类复杂问题,会有很多local minima,所以要尽量多的测试不同位点。也会有些文章用GCMC来找吸附位点 2. 作者估计是为了画图美观,实际计算应该还是用晶体的。如果单独切出来,势必要对边界原子做处理(比方说+H这些。) |
1773525076 发表于 2025-7-16 08:09 我觉得应该差不多,具体要看原文怎么写的 |
pal 发表于 2025-7-15 20:38 感谢大佬解惑 那我的始态和终态相当于都是自己放在不同位置进行优化后得到 然后能垒再在这两种状态直接寻找过渡态 不知道这样理解是否有问题 |
1 分子放到孔道的不同位置都会优化到一个极小值点,选择多个不同初始位点类似于构型搜索 2 这个应该是在周期性边界条件下进行的,对应于MOF体相 |
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