计算得到的水溶液中Hgcl2中Hg-O的RDF与实验现象不符，力场参数是否设置有问题

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发布时间: 2025-7-16 11:06

各位老师好，我最近在算的一个体系，遇到一些问题，期待能得到各位老师的解答。我的体系是第一部分想研究在水溶液中Hgcl2的扩散系数，因此我构建了一个500个水5个Hgcl2的立方体盒子，其中水我使用的是TI3P模型。现在 ...

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。。。 发表于 Post on 2025-7-17 09:57:53

sobereva 发表于 2025-7-17 03:35
sobtop根本不兼容CHARMM。改成include AMBER力场的forcefield.itp，水模型用此力场目录下自带的itp

好的，谢谢社长，我去修改后重新尝试一下

sobereva 发表于 Post on 2025-7-17 03:35:54

sobtop根本不兼容CHARMM。改成include AMBER力场的forcefield.itp，水模型用此力场目录下自带的itp

。。。 发表于 Post on 2025-7-16 14:19:50

sobereva 发表于 2025-7-16 12:05
专门研究“Hgcl2和水分子结合后，Hg-cl的键长和键角是会发生变化的” 这种精细问题，建议用CP2K跑DFT的AIMD ...

老师，如果不考虑这个的话，我就只用gromacs跑动力学，这个力场参数写的哪里有问题呀，总是不能很好地和实验的结果匹配

sobereva 发表于 Post on 2025-7-16 12:05:43

专门研究“Hgcl2和水分子结合后，Hg-cl的键长和键角是会发生变化的” 这种精细问题，建议用CP2K跑DFT的AIMD，而不适合基于力场的动力学

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