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求助sigma-hole变形的原因

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发布时间: 2025-7-16 21:56

正文摘要:

各位老师好,我在分析两个有机分子片段间的相互作用。体系如图一: 我的问题是: 1. 能不能在两个分子共存时算LEAE,还是说LEAE只能对单独一个分子算? 2. 如果能在两个分子共存时算LEAE,那么图三中箭头所指 ...

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wbqdssl 发表于 Post on 2025-7-17 17:50:00
本帖最后由 wbqdssl 于 2025-7-17 18:39 编辑
爱喝茶 发表于 2025-7-17 10:09
σ-hole有高度方向性,就是沿着键轴的延长线,而且普遍认为氟无法形成卤键,所以这里面你不应该去考虑卤键 ...

非常感谢您的回复,我同意您的观点;我刚刚在GaussView中把CF3基团换成了CH3基团,其他什么都没有改动。在同级别下算了这两个分子的相互作用能。在CF3时,相互作用能为-2.383kcal/mol,在换成CH3后,相互作用能变为了-1.253kcal/mol,看起来确实是由于CF3基团的存在使得相互作用变得更稳定了。同时我计算了氢键供体那个H原子的ADCH电荷,当是CF3时,ADCH电荷为0.277,当是CH3时,ADCH电荷为0.285,差异不是特别大。我不知道该如何解释这种现象,能再请您看看有什么比较恰当的原因嘛,谢谢!
爱喝茶 发表于 Post on 2025-7-17 10:09:33
本帖最后由 爱喝茶 于 2025-7-17 10:17 编辑

σ-hole有高度方向性,就是沿着键轴的延长线,而且普遍认为氟无法形成卤键,所以这里面你不应该去考虑卤键的因素。两个一起形成LEAE着色表面的蓝色我认为只能代表相对容易亲电的位点。

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