“第10届量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班将于5月4-8日于北京举办,这是一次性完整、系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的最不可错过的机会!请点击此链接查看详情和报名方式,欢迎参加!

“第18届北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 将于5月23-26日于北京举办。这是一次性全面、系统学习分子动力学模拟知识和最流行的分子动力学程序GROMACS的关键机会!报名正在进行中,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

用什么软件对已有的蛋白质结构进行调整

查看数: 519 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2025-7-28 12:11

正文摘要:

请问一下怎么对从UniProt上下载的蛋白质结构上的某些氨基酸进行结构调整,类似接上一个基团或者替换掉一个基团,PyMol可以识别氨基酸但不知道是否可以处理,MS可以处理但是没法识别氨基酸。有哪个软件可以识别 ...

回复 Reply

realcheryl 发表于 Post on 2025-7-28 15:18:44
student0618 发表于 2025-7-28 14:16
个人认为自己先摸索一下尝试所有按钮比很多教程都有用,特定功能的用法可以搜PyMOL Wiki (https://pymolwik ...

好的,太感谢啦!
student0618 发表于 Post on 2025-7-28 14:16:27
个人认为自己先摸索一下尝试所有按钮比很多教程都有用,特定功能的用法可以搜PyMOL Wiki (https://pymolwiki.org)

例如Mutagenesis 示例:https://pymolwiki.org/index.php/Mutagenesis

builder示例:https://pymolwiki.org/index.php/Builder
realcheryl 发表于 Post on 2025-7-28 12:40:15
student0618 发表于 2025-7-28 12:19
PyMOL可以。wizard mutagenesis换胺基酸,builder可以用来加functional group及换原子。

太感谢您啦,PyMol可以的话就方便很多了,但是我还不太会用PyMol,很多功能都不知道怎么使用,请问PyMol的操作有什么教程可以学习吗。
student0618 发表于 Post on 2025-7-28 12:19:21
PyMOL可以。wizard mutagenesis换胺基酸,builder可以用来加functional group及换原子。

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-13 19:51 , Processed in 0.213823 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list