求助CP2K计算透明质酸在锌表面的吸附时，进行结构优化，能量升高，小分子结构被破坏

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发布时间: 2025-7-31 12:34

本帖最后由 jamesl 于 2025-7-31 12:41 编辑各位好，我在使用CP2K计算透明质酸在锌表面的吸附时，对透明质酸进行了结构优化，在优化过程中，能量始终在升高，而且分子原有的结构被破坏，发生了明显的变形。使 ...

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ultramanm87 发表于 Post on 2025-8-1 00:53:37

透明质酸是聚合物吧，从建模的角度先确认下你截出来的这一部分的合理性。然后这么多羟基羧基考虑下溶剂的效应？

sobereva 发表于 Post on 2025-7-31 13:25:17

jamesl 发表于 2025-7-31 12:41
sob老师，我上传了输出文件和轨迹文件，请您看看是什么问题

把D4改成D3再试

jamesl 发表于 Post on 2025-7-31 12:41:42

sobereva 发表于 2025-7-31 12:37
没有输出文件、优化过的轨迹文件没法判断

sob老师，我上传了输出文件和轨迹文件，请您看看是什么问题

sobereva 发表于 Post on 2025-7-31 12:37:30

没有输出文件、优化过的轨迹文件没法判断

sobereva 发表于 Post on 2025-7-31 12:34:49

不要自己在标题里手写【求助】这种标签，http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你改了，以后注意

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