如何合理选取扩散系数的拟合区间

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发布时间: 2025-8-1 16:32

本帖最后由 Tracy民工于 2025-8-1 16:44 编辑一般拟合扩散系数会去掉震荡或者突然陡增的部分，那请问像图1中这种斜率出现变化，但是比较平缓的40ns-50ns区间应该选取吗？还是说选取完全接近直线的那部分呢（5ns ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-8-2 21:11:42

Tracy民工发表于 2025-8-2 11:04
谢谢sob老师，请问为啥到了平衡相后面反而不稳定了呢

越往后统计误差越大
参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX）幻灯片了解原理：

Tracy民工 发表于 Post on 2025-8-2 16:28:27

wanglg 发表于 2025-8-2 11:40
时间尺度增加后微观运动模式也会变复杂，不再适用简单的扩散系数公式。但你说的“到了平衡相后不稳定是什 ...

是的，是生产相，不好意思，想错了

wanglg 发表于 Post on 2025-8-2 11:40:52

Tracy民工发表于 2025-8-2 11:04
谢谢sob老师，请问为啥到了平衡相后面反而不稳定了呢

时间尺度增加后微观运动模式也会变复杂，不再适用简单的扩散系数公式。但你说的“到了平衡相后不稳定是什么意思？”，难道你50ns的模拟不是来自预平衡后的生产相吗？

Tracy民工 发表于 Post on 2025-8-2 11:04:49

sobereva 发表于 2025-8-1 22:13
取前60%

谢谢sob老师，请问为啥到了平衡相后面反而不稳定了呢

sobereva 发表于 Post on 2025-8-1 22:13:11

取前60%

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