sobtop基于m2Seminario方法产生的参数合理性问题

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发布时间: 2025-8-11 15:39

各位老师好，我需要对一个含Co、O、H元素的层状体系进行基于经典力场的MD模拟，由于无现成参数可用，遂采用sobtop基于m2Seminario方法产生参数。利用mol2文件和cp2k的频率分析文件作为输入。顺利得到了参数。但是 ...

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TretopL 发表于 Post on 2025-8-12 07:53:03

sobereva 发表于 2025-8-12 02:37
可以
但如果是单层的有柔性的纳米片，这样做可能无法如实体现出纳米片结构的波动

好的，谢谢sob老师的解答

sobereva 发表于 Post on 2025-8-12 02:37:53

TretopL 发表于 2025-8-11 19:11
谢谢sob老师回复。
那我是为了研究这个纳米片在溶液相对溶液中一种离子径向分布的影响，已经找到了合理 ...

可以
但如果是单层的有柔性的纳米片，这样做可能无法如实体现出纳米片结构的波动

TretopL 发表于 Post on 2025-8-11 19:11:48

sobereva 发表于 2025-8-11 18:17
如果只是为了维持刚性，力常数直接猜个不大不小的值就完了，没必要基于Hessian算

谢谢sob老师回复。
那我是为了研究这个纳米片在溶液相对溶液中一种离子径向分布的影响，已经找到了合理的epsilon和sigma，能不能直接把这个纳米片结构直接冻了呢？

sobereva 发表于 Post on 2025-8-11 18:17:23

如果只是为了维持刚性，力常数直接猜个不大不小的值就完了，没必要基于Hessian算

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