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请教LAMMPS轨迹在VMD中分子显示不完整的问题

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发布时间: 2025-8-13 16:37

正文摘要:

老师好,经DeepMD + LAMMPS 产生了dump文件,并采用ovito输出xyz文件。目前想要使用VMD查看轨迹中分子的动态情况,一开始导入出现结构混乱后采用Dynamic Bonds显示,但是发现一部分帧会出现分子缺失的情况(检查xyz文 ...

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qingqingBANG 发表于 Post on yesterday 14:50
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-8-13 19:08
这是我看到的第三个以为LAMMPS无法直接输出VMD支持查看的轨迹文件、非要绕远路转换格式的情况了,我实在不 ...

好的,谢谢老师,已解决
qingqingBANG 发表于 Post on yesterday 14:50
sarphuart 发表于 2025-8-13 17:06
http://bbs.keinsci.com/thread-20047-1-1.html

好的,谢谢老师
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 前天 19:08
这是我看到的第三个以为LAMMPS无法直接输出VMD支持查看的轨迹文件、非要绕远路转换格式的情况了,我实在不理解为什么。看http://bbs.keinsci.com/thread-54542-1-1.html我的回复。
sarphuart 发表于 Post on 前天 17:06

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