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如果利用shermo计算一个涉及H2O和OH-生成的反应的自由能变

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发布时间: 2025-8-14 21:35

正文摘要:

本帖最后由 NEW12138 于 2025-8-23 22:41 编辑 我想要计算A+B→C+H2O+OH-(其中A带两个正电荷,B带两个负电荷,C带一个正电荷)这个反应的自由能变 首先我在#p opt freq B3LYP/6-31G(d,p) em=GD3BJ scrf(solvent ...

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NEW12138 发表于 Post on 2025-8-24 16:53:42
sobereva 发表于 2025-8-24 02:35
3 算弱相互作用和算化学反应能对基组的要求截然不同,不同目的该用什么用什么。你这种目的应当用的是def2 ...

好的,太谢谢老师了,我会好好考虑的
sobereva 发表于 Post on 2025-8-24 02:35:52
NEW12138 发表于 2025-8-23 23:19
谢谢卢老师详细的回复。因为前段时间一直在赶实验,计算这一块没顾上。下面是我对您回答的进一步了解与回 ...

3 算弱相互作用和算化学反应能对基组的要求截然不同,不同目的该用什么用什么。你这种目的应当用的是def2-TZVPP,看
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html

5 需要算过渡态。这是研究化学反应问题最基本的环节
北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KEQC)专门有一节极其详细讲了找过渡态的方法和原理,并给了十几个覆盖各种情况的找过渡态的例子,系统学一遍很快就能顺利上手,远比看零七八碎的帖子学起来快多了、顺利多了
sobereva 发表于 Post on 2025-8-14 21:44:26
帖子标题是病句,及时修改

不要在缺乏常识的情况下随便乱试、乱做出结论。“发现3的结果与前两者有明显区别,最后选择了3”这种做法毫无意义。不同的热力学模型的差异在Shermo程序手册附录都写明了,起码先看了了解是怎么回事再说

B3LYP/6-311+G**算电子能量如今普遍发不出去文章。看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html
以及http://bbs.keinsci.com/thread-12773-1-1.html

下文明确说了怎么算溶剂下的自由能,文中搜1.89
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html

图省事的话,A、B、C怎么算自由能,H2O和OH-就怎么算,然后自由能求差
但OH-光靠隐式溶剂模型描述误差较大。明显更好的做法是设计热力学循环,把溶剂环境下的自由能变计算成“气相自由能变”和“产物与反应物之间溶解自由能的差值”的加和。此时OH-可以用更严格的方式算溶解自由能,包括利用显式溶剂模型,并且OH-在水中的溶解自由能肯定能直接查到较准确值。

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