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楼主,您好,想请教以下任务是由于网络连接所产生的失败吗?尝试聚合共聚维酮PVP VA64的结构,两个SMILES式子都使用了楼主所述的结构检查网站https://cleanenergymaterials.cn/autocompute/smilesdrawer,没有发现明显问题。 任务id:gAAAAABptUvKjSe1qEA0azobv3_ikcpJTzYZUrJfSOosSzsdQopsGwlAiKrdQ32EL5AjK6SwZvLstIAQNtgfhQFdBOmE2ElTGhZTGRQsfRXtveorBYFbscXBgI6QZpvkRjKzoNCG4xE1WcwlI2fgZtoJomell8vFnjju7SarX-GOY-VvyMVPpkNHu6Vhos07mqOi_3NKN3w2vuc7DIAIqanN5hqceZqgcfOgN4yTXIEtrX_T5TrjNS8xMtvDs8pEGN9cxzsaMpAukNIaPweve6gqwHK6UrEPzDA8AF-q9l1xEfkUOwQSuiLUXafPMjk6vzOcdm9BhpiJP_u3pQizUptyTb4g7zQHZW5TxDxJIu4Dv2DorCYR0CRaJvqCPyDXREFH6NFeydtzjk-GBie1qD5TIApkkH3aC5Ou3LxhC642s-5Eptx_xCs3BheyGCMxZL6Q9Oce8Wed 线性聚合 聚合方法:Random Copolymer 单体: NVP SMILES:O=C1N(CCC1)C([星号])C[星号];重复数目6 VAc SMIKLES:CC(OC([星号])C[星号])=O;重复数目5 Checker返回的报错提示是:Failed to run notebook 2_Polymer_chg_and_Polymer_creation_Linear_polymer.ipynb: Connection to 10.158.157.58 closed. 如您能抽空回答,十分感谢! ![]() |
bubaixiji 发表于 2026-3-11 13:39 晚上看,恢复了,应当是网页维护 |
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本帖最后由 bubaixiji 于 2026-3-11 13:41 编辑 很好用,不过电荷有一点问题,我主要是用来生成聚合物结构的。 前几天还能用,但是今天(2026年3月11日)发现进不去了,不知道是因为更新还是什么 |
3d0f8321-ce4b-4e76-93ad-ff55e3536d44.png (31.63 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)
| 进入网页,为什么点击不了generate polymer |
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王博,太好用了。诸如CMC-阴离子,聚离子液体等结构的无规共聚也能完全重现出所需要的partial charge。对称共轭位置上也是相等的电荷和同样的力场类型。 此外我完全同意楼上的一个建议,就是给出选项不计算电荷或给出快速的MMFF94电荷,同时保留RESP电荷计算时的大基组,高标准高精度。 |
202512051414443509..png (11.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 28)
今天简单使用了一下,挺不错 ,有几个问题和建议:1. 今天试的两个例子均出现了原子净电荷不为0的问题,1400左右原子大概会有5个电荷的偏差; 2. 可以添加个选项,不进行原子电荷计算,只输出结构(考虑到有些用户可能只需要结构),这样会降低不必要的机时消耗; 3. 考虑到聚合物这么大的体系,体系优化也没必要使用6-311G**这么大的基组,一般的6-31g*其实就可以,orca中的B97-3c方法是一个很好的选择,或者是xtb的GFN0-xTB方法。 最后,感谢大佬耗费精力做的网页 ![]() |
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本帖最后由 牧生 于 2025-10-20 09:06 编辑 gAAAAABo9YWvPKeeu0Woyjb1k5FG9gSi9scycKWyiETrnhqI_D5CUeEZ7h49TszCUccE1tmLRQn5j89Y8tyYpPIbVO6IWRjmz8J0KUvalfOBbFvlFJv4LYdjFl9jDubYh0RqBm8MGKZbZ7GoW1RpkBDT1-HE6J49H5lupV0mL9xUYplSSNNyYLizJ-7iCAQHEPeFNsX378V*So9rm8K3XC6AyZyQL9OWlYm_z6j1_arJcz13-oBgKAKXPRBPT1CPZjq_lFzAYAC-oGBD4olrSbOcFhyRhvKBi_ZOKbjVlzLUw7fSlzG6wZENRJEeJr5Z0C8yfTCpMtKHBIpKWuLCELOs6GLZDoycAaF1k_KGUM8_3A7H9IhP-uwPEpKnr-fL6118suHWf0itGCmUpPAMrvCPuCMmevduo8-VcKpeaJB_An2eqv7AvNiJgkYSMRlzh0PujbSCv8Ue 请帮忙看一下,近日发现生成的聚合物的总电荷不太对劲。。 如上是我用9个不带电的丙烯酰胺和带1个带-1电荷的丙烯酸得到的无规聚合物,但是得到的总电荷为 +7.460962 |
Xexhauster 发表于 2025-10-9 17:20 我也是今天下午提交的,状态显示成功了,但是下载出来显示是一个空的 |
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求助 status显示success后,下载的all_results.zip里是空的,这是为什么 gAAAAABo53PsIAsBSiZgcwmhXKarzCLdX5Y288tU3hV4VL4lqQ5qQ1ax_9_k4mFZDN8x4aGk5ZYf5YpVmnsOIbwBVEyic0hpe7Uf6DorAloKo_q1E7cXRUBzTc8s-eVlEIz30AH-GTmi1J3AWDb7y7PFsQ1gA8vWbUboYU2sVu0X9kSUDYJY29LDhAXWBTg8NnbInS1i91IupHB1BSjvW7NRmGUzHYMM_Qp8eJhwgYQyQCjZNnQDDfTDRjW7M4yZIk7l9Hq5oFEQ3cHEUcabZ93MinP3nOwiqwZHLL0wtVRza8mls7fr7C3GYB1HQNvzJHcE9jTSb81cGQBP2f1LerMuX0NIXcNulJVx1x4wnT42vf0z0R_URe3B77wCsIzg5QULGCna6BZvV-x4dS3ITOCO80D-irho5tGXCjPuE_i6M72WkVKOQD8= |
| 求助一下,我的taskIDgAAAAABoypz9Mwgn8atgRX9YmKL0afOtvxQHWumwamrKuZgsil3hXFZaHCNnAhwGNP9NCULt3vicJV2H4AllWIr5J-ltoX495HuYKKlvSD8abpEgzCk4eRqaANlIuhnh_Cmk-LZ-PAVwNKGN_PJBTqqSmU6PFvo_YJhmYc5bci9FH3hjTkR03xEJ92AnbbFZQe1OnDVJjJm4Ik9C3pDNaqhOV_vgwFwco3ESvyrztrVwxbzwoUD2Kufkz6pO-YMYBRmO2EArrub18uRFSqMXESgATV-XEE811MyXxb8IMIssyKjNBWPEpwoL6QauByn4mdM-JS4k5BkZ7_6Mgbf2HVkwwqvLzgd5GDLqwrxyWDkCyWtb6RyRr3p4UHoSIdKqmMYBukjB5w808M8Qk-PnseJCqy73oxNHBg3C3TgL6p45LJ_syP7c7G_8oX5iOrRx3v25TcRUpZBU,9.17的,还是显示Task is still processing. Please check again later.是怎么回事 |
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本帖最后由 牧生 于 2025-9-13 14:57 编辑 gAAAAABoxQ1i4DcWFWyuLdqYnqomWRpp7IZxOPFpV5GuM_nL9paGf6Obkp9Tb0BBN8aH_i5XKOQGO_3ZBmhuveV_WuYxnJxM9eCBiDljq-YUhY4R1JE-nRCynyOFzSReb2MbcVDFiygwI82F1_rs4X7PllxgVh7fMvVy0LrSxjmSFdZgTITRr6rMGHBbGEcUUmh4-FT6lsUPmICE0toLBtiUTnaE0ivz4nFbYa2HMg_iCscjxRsfsiwd17fj20355lKC9_HLusSYPr4CwZPkL9hAGje9PAl9s6MGQ28Tyb51bBIYw0wfHOuSJ0bn2qrdzNDxO8OwimMF_Gw09iYyMx4nR59GK87pcqliPpI4KLD1lX80Rai9nlBkDvFrdW4-a5YBiVBZUTCRM4d-GnidalzXPCQjUcyd3w_f1nJFIjX9UB1R1G-zxSh0JWT3aBqhSw3Umxwg7S02 请帮我看一下这个嵌段聚合物,是PEG和甲基丙烯酸二甲胺乙酯的嵌段物,但是最终的总电荷不为0,这是为什么呢 如果重复单元数更多,将导致电荷偏离0更多。 |
| 期待适配lammps |
王纪峰 发表于 2025-8-29 16:09 不好意思哈, 任务ID是gAAAAABor8ESM8Ti9PLbew1bpwBowA71DnsD_h5g6kQiE5SKYUonG9JyAUpAnjGv01_EbcgWT22-1qhLaHAfzoAhYHmkbdP-_rhhCij3ZbBXwd7odrc3yelKnJvA9UrQ9EQiOoE2zhaVHqnzGC7JsiRdZEq7Qm5s9EteUWzEOgJI1MEaE8Ho8BzAEa6GvfqleePIYitv_v1fdL23cIuk7qLSRBV3iLpTZTLTGQ7oobvD7gJJcjSlDGVtZU9iiltdhEOjiK5zdrM7Cm8AtfOCpk6snkJKDrO2P5w7Vk-7m5KpyUG8biPpuDeeVmDXt2U-kObO5akDwnRbFV5CRcoBo7ky7OVVAunaBLOR3I6246xAYya8QQkfY0gnurPH-x3JOU4QYEtGDDe2P3F4RxTBSzCXeijxWrsk3-uL8JK9SXluHuL9CvS7X-c= |
牧生 发表于 2025-8-30 10:53 可以的,这个从算法上来说不难修改,近期就会修改,上线了通知您一声。 |
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