使用VMD打开md.gro出现提示检测到残基之间(水分子)存在异常键（Unusual bond）

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发布时间: 2025-8-22 19:22

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sobereva 发表于 Post on 2025-8-23 12:50:09

该写在帖子正文里的内容不要只体现在帖子标题里，就如同一篇文章只有标题/摘要而没有内容一样
按照提示，用VMD显示出来相应的残基，肉眼看结构，看有什么异常，如果有严重不合理接触，从模拟设置、拓扑文件层面试图分析原因。如果只是距离稍微近一些导致VMD判断成了成键，可以无视

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