如何添加盒子的边框线

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发布时间: 2025-8-26 10:32

各位老师好，我在用packmol软件构建好.pdb的模型盒子后，将其导入VMD观察，发现盒子是没有边框线的，想问一下如何添加呢？之前在搜索问题的看到有老师回复在VMD中输入 pbc box -color black -width 1 -style dashed ...

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璃陌51129 发表于 Post on 2025-8-26 14:41:29

pal 发表于 2025-8-26 14:20
这是因为pdb里面没有包含盒子大小的信息，先要通过pbc set {x y z}添加盒子

谢谢老师，已经成功添加上了

璃陌51129 发表于 Post on 2025-8-26 14:38:08

pal 发表于 2025-8-26 14:20
这是因为pdb里面没有包含盒子大小的信息，先要通过pbc set {x y z}添加盒子

感谢回复，请问是要先在VMD中给这个pdb添加盒子信息吗，比如我的盒子是50*50*50的，是先输入指令pbc set {50 50 50}？
然后再输入pbc box -color black -width 1 -style dashed指令吗

pal 发表于 Post on 2025-8-26 14:20:17

这是因为pdb里面没有包含盒子大小的信息，先要通过pbc set {x y z}添加盒子

方方方 发表于 Post on 2025-8-26 11:29:02

pbc box，会自动添加盒子信息

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