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发布时间: 2025-8-26 15:20
正文摘要:请问各位老师： 其中S···H的距离是1.91Å，H···O的距离是1.05Å 使用的泛函和基组是B3PW91/6-31G(d,p)，其中Fe用的赝势基组，加了em=gd3bj及隐式溶剂模型 问题：S、H、O的位置不管怎么调，都找不 ... |
zzs799 发表于 2025-9-6 21:46 找不到过渡态不是问题，本来就不是所有反应都有过渡态，reaction profile不画过渡态、SI给扫描结果证明没有过渡态就行了。但是负离子如果能让这个反应从吸热变放热（或者反过来）的话，说明负离子的位置很重要，不能随便摆，需要做构型优化，这个才是问题 |
wzkchem5 发表于 2025-9-6 15:42 是的老师，我又检查了一下文件，计算没有什么问题，因为这个反应之前还有几步，硼酸根负离子都是一直带着计算的，这一步的过渡态找不到有没有可能是因为这个负离子的位置吗，但是去掉负离子单独找质子转移这一步也是找不到相应的过渡态 我还做了限制性优化，固定了S和H以及H和O的键长，此时有虚频，且振动方向是想要的过渡态的样子，但是解除限制以后，也是找不到想要的过渡态。 |
zzs799 发表于 2025-9-6 14:53 把负离子拿掉以后能量变化趋势反过来了？如果确定计算没有问题的话，这个结果有点奇怪，说明负离子的效应很强。建议通过构型搜索确认一下当前的负离子位置是不是最优的 |
wzkchem5 发表于 2025-9-6 14:51 不好意思老师，我输入错了 都是扫的S-H键，现在已经改正过来了 |
zzs799 发表于 2025-9-6 14:39 如果要研究的是质子转移，应当扫描S-H或O-H距离，而非O-S距离。因为反应过程中O-S距离先减小后增加，不是单调变化的 |
zzs799 发表于 2025-9-3 19:14 只有周期性体系计算才有电中性的要求。有的网上教程会说第一性原理计算体系必须满足电中性，但没有指出只有周期性计算才有这个要求，要注意辨别 |
zzs799 发表于 2025-9-3 19:14 孤立体系的量子化学计算根本没有什么“整个体系呈电中性”的强制要求，浓度不很高的水溶液里强电解质电离产生的阴阳离子本来就该分离，更何况[B(C6F5)4]-是非常经典的Non-coordinating anion而并不容易形成这样的团簇。 |
Hugo_314cat 发表于 2025-8-27 13:41 硼阴离子使整个体系呈电中性 |
| 我问一个偏有机的问题：这个硼阴离子真的需要出现在这个结构中吗？因为真实环境下你几乎无法获知两者的几何位置关系，同时这么做也很容易给你的计算造成麻烦。 |
zzs799 发表于 2025-8-26 16:43 对 如果你的结构优化用了赝势，那么扫描也必须用 |
wzkchem5 发表于 2025-8-26 16:31 老师，我现在在做柔性扫描了，是不是做出来的没有极大极小点就是无垒反应，还有做扫描的时候赝势基组也要写进去吗？ |
sobereva 发表于 2025-8-26 16:28 不好意思老师，我看错了 下次我会注意的 |
| 确定这个反应不是无垒反应吗？ |
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