入门就不要用AI，你不知道对不对，强烈建议不要用AI，没有任何作用

感觉mdp没有太大问题，你可以试试在最后正式模拟的时候用命令把bond，PME这些放在GPU上面跑一下试试，还有一个就是按照楼上的说法随便跑个模拟试试

gmx 版本？gmx --version？最好也有mdrun 的命令和mdrun时终端显示的内容。

sobereva 发表于 2025-8-28 11:01
整个帖子内容乱七八糟，一塌糊涂，提问内容不知所云，你自己不觉得看这个帖子极其费劲？
尽快重新编辑帖子 ...

已经改正并重新上传了 sobereva老师 不好意思

樊樊樊 发表于 2025-8-28 11:24
可以直接上传mdp文件，这样大家能直接下载了看，如果复制粘贴确实有点混乱

已经上传了 确实是拿AI生成的，第一次弄没什么经验

可以直接上传mdp文件，这样大家能直接下载了看，如果复制粘贴确实有点混乱

整个帖子内容乱七八糟，一塌糊涂，提问内容不知所云，你自己不觉得看这个帖子极其费劲？
尽快重新编辑帖子，并且仔细阅读

在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚、完整
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）
在网上求助计算化学问题时的注意事项
http://sobereva.com/79（http://bbs.keinsci.com/thread-57-1-1.html）

mdp里的内容乱七八糟，如果你目前还是用AI产生mdp或者从可信度来路不明的地方抄mdp，建议趁早从头系统学一遍GROMACS，免得绕各种弯路、踩坑。北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX）对GROMACS的使用讲得极尽详细，给了面向各种问题的全面的例子

问这种问题的时候最好给gmx 版本、gmx --version显示什么。

然后那个註解在加不必要的东西，是哪AI想避雷一下。

mdp文件不叫编译，而且这注释看着怎么一股AI味儿呢，

把问题格式改改好，不要求对齐至少一行一句吧，交代清楚报错是什么，这个排版叫人怎么看。

问之前自己调试调试，跑一个最简单的模拟看看能不能使用GPU, 能的话就是模拟设置问题，否则就是编译问题。