求助：clustsize命令报错

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发布时间: 2025-8-28 10:51

老师好，我的体系是有机溶质在水中自组装进而形成胶束/凝胶/浊液，我想利用gmx clustsize命令查看溶质分子在水中的聚集情况，但在我输入gmx clustsize -f XXX.xtc -s XXX.tpr -mol后，就会报错。我想请教一下： 1. ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-8-29 06:02:46

oillio 发表于 2025-8-28 15:23
老师那这样是不是就是原子归簇了？cutoff还能使用默认值吗？

加上-mol就完了

oillio 发表于 Post on 2025-8-28 15:23:20

sobereva 发表于 2025-8-28 11:09
结合索引文件，指定只对溶质组统计

老师那这样是不是就是原子归簇了？cutoff还能使用默认值吗？

sobereva 发表于 Post on 2025-8-28 11:09:05

结合索引文件，指定只对溶质组统计

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