关于溶剂可及表面积的计算问题求助

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发布时间: 2025-9-10 14:59

各位老师好，我在模拟一个有机物在水中的聚集情况。利用gmx sasa -f XXX.xtc -s XXX.tpr -n index.ndx 计算了它的溶剂可及表面积（sasa）——整个有机物的sasa、其头基的sasa以及尾基的sasa。模拟期间可能发生了尾部 ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-9-10 19:35:53

all明明比head小，而不是更大

用VMD将相应部分以SAS方式显示，并且SASA也用VMD计算，图像和数据进行对照，自然能搞清楚怎么回事

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