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想请问大家Multiwfn3.8(dev)版本,关于计算Huang-Rhys

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发布时间: 2025-9-24 18:23

正文摘要:

想请问大家关于Multiwfn3.8(dev)是否有振动分析功能,从而可以计算Huang-Rhys。

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清明雨上 发表于 Post on 2025-10-28 11:09:31
本帖最后由 清明雨上 于 2025-10-28 11:47 编辑
St_Maxwell 发表于 2025-10-24 14:27
两者的差别来自于计算Duschinsky转动关系时以哪一个态作为参照,以及后续计算Huang-Rhys因子和重组能时是 ...

您好,我用四点法算出我的体系总的重组能λ(I)+λ(II)为0.41eV。我在分解程序中的计算:第一次计算initial_state设置为s0, final_state设置为s1;第二次计算initial_state设置为s1, final_state设置为s0,将两次计算总的结果相加得到
λ(I)+λ(II)(不知道这种做法是否正确)Lyra中以末态为参考算出来总的重组能为1.77eV,Gaussian算出来为0.52eV。

如果计算方式没问题的话,对我而言,还是以初态为参考更合适了。
清明雨上 发表于 Post on 2025-10-24 18:13:04
本帖最后由 清明雨上 于 2025-10-28 11:12 编辑
St_Maxwell 发表于 2025-10-24 14:27
两者的差别来自于计算Duschinsky转动关系时以哪一个态作为参照,以及后续计算Huang-Rhys因子和重组能时是 ...

感谢感谢,行家一出手,就知有没有
以末态作为参考更有物理意义一些,对于我的课题也明显解释的更合理。
St_Maxwell 发表于 Post on 2025-10-24 14:27:57
清明雨上 发表于 2025-10-23 15:27
您好,hessian与梯度计算的fchk文件文件有点大了(超过了9.8MB无法在公社上传),请问您是否可以私发一下 ...

两者的差别来自于计算Duschinsky转动关系时以哪一个态作为参照,以及后续计算Huang-Rhys因子和重组能时是在哪一个态的势能面上。
我看了一下fcclasses的手册(Gaussian的FCHT计算模块来自于这个程序),它计算位移是以初态势能面为参考的。(Shuai等人的文章也是这样定义的,见J. Phys. Chem. A 2010, 114, 7817–7831的(7)式)
但是我倾向于基于末态势能面计算Huang-Rhy因子和重组能,这样和跃迁过程是对应的。
例如初态是S0、末态是S1的吸收过程,垂直激发之后的结构弛豫发生在末态S1的势能面上;而垂直发射过程之后的弛豫发生在末态S0势能面。见Dushin程序的文章J. Chem. Phys. 115, 9103–9109 (2001)的(18)式。
目前我改了一下Lyra,AH分析时会分别输出以初态作为参考和以末态作为参考的结果。对于你的例子,执行python lyra.py evc S0.fchk --AH S1.fchk之后,会先以S0(初态)为参考态输出计算结果,然后以S1(末态)为参考态输出结果。前者和Gaussian结果基本一致,后者则是之前用Lyra得到的结果。你可以自己决定选择哪一个。

P.S. Lyra在计算初态频率时只会将其笛卡尔坐标平移至原点,没有投影到Eckart朝向下(即惯量主轴)。虽然不太影响结果,但是以后会加上。

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清明雨上 发表于 Post on 2025-10-23 15:27:20
St_Maxwell 发表于 2025-10-23 00:11
你发一下相应的hessian与梯度计算的fchk文件,还有对应的gaussian FCHT计算结果,我仔细比对比对。
如果 ...

您好,hessian与梯度计算的fchk文件文件有点大了(超过了9.8MB无法在公社上传),请问您是否可以私发一下邮箱或者其他联系方式,我私发您。
St_Maxwell 发表于 Post on 2025-10-23 00:11:58
清明雨上 发表于 2025-10-20 11:22
您好,您的程序非常好用!但是对于我的结构,得到的重组能为7859 (cm-1),而基于Gaussian FCHT(http://b ...

你发一下相应的hessian与梯度计算的fchk文件,还有对应的gaussian FCHT计算结果,我仔细比对比对。
如果需要引用,可以引用程序的github仓库网页(不引用也行,只要审稿人或读者没意见)。
清明雨上 发表于 Post on 2025-10-20 11:22:34
本帖最后由 清明雨上 于 2025-10-20 11:34 编辑
St_Maxwell 发表于 2025-9-24 23:39
我有一个用python写的小程序,支持绝热Hessian(AH)以及垂直梯度近似(VG) https://github.com/St-Maxwel ...

您好,您的程序非常好用!但是对于我的结构,得到的重组能为7859 (cm-1),而基于Gaussian FCHT(http://bbs.keinsci.com/forum.php ... ighlight=huang-rhys)结果为2367 (cm-1),有不小的差距。
对于我的体系而言,对比下来您的程序的计算结果更加合理,请问这是为什么呢?
另外,打扰您一下,如果我在文章中使用了您的程序,我应当如何正确引用呢?
sobereva 发表于 Post on 2025-10-9 14:36:09
qeheikj 发表于 2025-10-8 11:07
VG和Ah是什么代表什么?

北京科音高级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KAQC)讲振动电子光谱部分专门说了

qeheikj 发表于 Post on 2025-10-8 17:56:00
wal 发表于 2025-10-8 16:19
这种基础问题自行搜索吧。指路ORCA手册有详细解释。

好的,谢谢
wal 发表于 Post on 2025-10-8 16:19:28
qeheikj 发表于 2025-10-8 11:07
VG和Ah是什么代表什么?

这种基础问题自行搜索吧。指路ORCA手册有详细解释。
qeheikj 发表于 Post on 2025-10-8 11:07:25
wal 发表于 2025-9-30 16:27
如果你要用VG,那不是这么用的,你要在同一个结构做一个gs的freq和一个td的freq。如果你要用AH,那你这个 ...

VG和Ah是什么代表什么?
wal 发表于 Post on 2025-9-30 16:27:42
qeheikj 发表于 2025-9-30 15:56
你好,我打算计算Huang-Rhys ,我是分开优化结构和计算频率的,两个压缩包分别是基态和三线态计算频率的 ...

如果你要用VG,那不是这么用的,你要在同一个结构做一个gs的freq和一个td的freq。如果你要用AH,那你这个freq没有任何意义,结构优化的时候对激发态哪个root做的,freq也必须对激发态哪个root做
qeheikj 发表于 Post on 2025-9-30 15:56:12
wal 发表于 2025-9-29 21:42
我问个题外话 为啥你这两个文件计算都是S0的freq 这样分解重组能是要算啥性质呢

你好,我打算计算Huang-Rhys ,我是分开优化结构和计算频率的,两个压缩包分别是基态和三线态计算频率的输出文件。您说的TD是指优化没写root吗?我检查优化输入文件是写了的。
wal 发表于 Post on 2025-9-29 21:42:20
本帖最后由 wal 于 2025-9-29 22:06 编辑
qeheikj 发表于 2025-9-29 21:32
你好,可以麻烦您有空在帮我看一下吗?我把固定的原子解冻,重新优化了一遍,并计算频率,查看频率fchk文 ...

我问个题外话 为啥你这两个文件计算都是S0的freq 这样分解重组能是要算啥性质呢


结合这个抽象受力我猜你忘写TD了

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