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求助,molclus+xtb对含F的萃取配合物结构优化出错

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发布时间: 2025-9-26 17:09

正文摘要:

本帖最后由 随我旅行可好 于 2025-9-26 17:08 编辑 各位老师好,我使用GROMACS进行萃取配合物团簇初始构象的产生,然后使用molclus+xtb进行结构优化和能量计算。图1是GROMACS产生的结构比较符合预期结果,是萃取 ...

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随我旅行可好 发表于 Post on 2025-9-27 22:09:17
好的老师,我用GFN2-xTB+溶剂模型试试
sobereva 发表于 Post on 2025-9-27 02:38:57
你没说清楚molclus调用xtb做的具体什么级别的优化,没法回答。GFN0-xTB和GFN2-xTB精度差十万八千里。结构图也看不清楚。对于含离子的体系,溶剂模型下优化建议考虑溶剂模型。
另建议找有代表性的一个初始结构,手动用xtb做优化,看优化轨迹,弄清楚优化过程的结构变化是怎么回事、判断合理性。

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