Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-10-9 10:48 这样对于内存的需求量太大了,我们的服务器不太行 |
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-10-9 10:48 谢谢 |
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-10-9 10:48 明白了 |
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-10-9 10:56 编辑 XxxXOO 发表于 2025-10-9 10:08 一个结构能只用gamma点/原胞计算就算准还是必须要用更大的k点/超胞才能算准,取决于波函数特征和周期性方向的尺寸,在没法用k点的场合应当编辑结构用复制扩胞来代替。比如,用3x3x1的k点做几何优化后,按3x3x1复制所得原子坐标、倍增盒子尺寸来扩胞(也可用MULTIPLE_UNIT_CELL关键词,注意不止一处出现),再做gamma点的计算获得波函数文件。 注意复制扩胞的操作不会改变覆盖度,和在建模时确定覆盖度是两码事。比如初始结构是(111)面上4x4的区域吸附1个分子,那按3x3x1扩胞后原子坐标和盒子尺寸对应12x12的区域吸附3x3=9个分子,而不是12x12的区域吸附1个分子。 |
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-10-5 12:52 我可以把k点得到的最终结构,只用gamma点做个单点能计算,去得到molden文件去做相互作用分析? |
XxxXOO 发表于 2025-10-5 12:17 这得看你的特定研究目的咯,要研究吸附的什么性质(以及预计随吸附浓度变化的收敛性如何),用来吸附CO的银是孤立团簇还是周期性晶体的某个晶面,以及吸附的浓度/覆盖度是多少(不指明的话可能会按无限稀/极低覆盖度理解)。如果是周期性晶面,显然为了保持完整的平移对称性,盒子尺寸只能取选定晶格矢量的整数倍(然后再确定计算的参数如k点等)。没有更多信息也不便进一步讨论。 |
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-10-4 13:21 那我应该怎么确定盒子的尺寸呢? |
| 虽然没有结构文件但由图可见(直接复制我前帖的话)盒子尺寸完全不对,三个方向都有大量真空区使得体系成了孤立团簇。不知道这建模怎么弄的,反正生成CP2K输入时给multiwfn读取结构的文件必须记录合理的晶格矢量,比如用cif之类。扩大晶胞必须考虑基底在周期性方向上的完整连续,不是在有了原子坐标之后简单改盒子尺寸就合理的。并且吸附体系应当考虑盒子尺寸与覆盖度的关系。 |
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