关于gromacs模拟时出现Atomtype c3 not found问题

查看数: 153 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

GHL

发布时间: 2025-10-5 20:18

本帖最后由 GHL 于 2025-10-5 20:20 编辑各位前辈好，我在做gromacs培训班里的关于常温常压下模拟乙醇+水盒子的模拟的练习。参考资料中描述为：将ethanol_GMX.itp改名为ethanol.itp。将其中[ atomtypes ]中的 ...

回复 Reply

GHL 发表于 Post on 2025-10-7 07:06:18

sobereva 发表于 2025-10-6 11:34
培训里的例子的每一个步骤都是有确切用意的，哪能随便忽略
amber99sb-ildn.ff就在GROMACS的top目录下，如 ...

好的，谢谢社长回复，按照资料上的操作步骤，程序运行已经正常。

sobereva 发表于 Post on 2025-10-6 11:34:43

培训里的例子的每一个步骤都是有确切用意的，哪能随便忽略
amber99sb-ildn.ff就在GROMACS的top目录下，如果连top目录都不知道是什么，重新复习“GROMACS的使用基础”里面“GROMACS的目录结构”那页幻灯片（约在那一节的第15页）

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register