求助：关于计算rdf选区片段的疑问

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发布时间: 2025-10-9 02:32

请问文献中这种分子片段的质心之间的rdf如何计算呢？我能选取整个分子的质心，但是像这种不同片段的质心的选择语句和索引文件应该如何构建呢？

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知食分子 发表于 Post on 2026-1-15 14:59:38

我有同样的疑问，请问现在问题解决了吗？

Lisy 发表于 Post on 2025-10-9 18:31:11

sobereva 发表于 2025-10-9 14:14
试图利用原子名作为选择语句选择分子中的特定片段。moleculetype里每个原子的原子名都是唯一的

卢老师，就是用片段的某个具体原子来近似代替局部片段的质心是吗

sobereva 发表于 Post on 2025-10-9 14:14:51

试图利用原子名作为选择语句选择分子中的特定片段。moleculetype里每个原子的原子名都是唯一的

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