计算台阶图时出现碳正自由基该怎样建模？

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发布时间: 2025-10-9 12:23

在计算有机吸附物台阶图过程中，其中一个结构存在碳正自由基，如下图所示：那么是否可以确认其中单键变为双键是Materials Studio可视化问题？那么是否可以认为优化后的结构是正确的？

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jiandan 发表于 Post on 2025-10-9 20:30:16

pal 发表于 2025-10-9 19:18
有没有试过在没有基底的情况下优化这个分子，能不能得到需要的结构

谢谢老师，我刚才将初始结构的基底去除掉进行结构优化。但是得到的结果依然是双键。键长变为1.385埃。可能不是基底的原因。

pal 发表于 Post on 2025-10-9 19:18:47

有没有试过在没有基底的情况下优化这个分子，能不能得到需要的结构

jiandan 发表于 Post on 2025-10-9 14:41:58

pal 发表于 2025-10-9 14:16
单双键根据键长判断，一开始建模的时候是不是就是单纯把单键变成了双键

谢谢老师回答，初始结构中将含碳正自由基与呋喃环相连的C-C单键键长刻意调成1.501埃，优化后的结构中键长变为1.389埃。那是不是说明是优化的问题？那么应该如何进行建模/设置参数？

pal 发表于 Post on 2025-10-9 14:16:32

单双键根据键长判断，一开始建模的时候是不是就是单纯把单键变成了双键

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