请问大家有没有统计AIMD模拟轨迹中的水分子取向的VMD脚本？

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发布时间: 2025-10-16 15:39

请问大家有没有统计AIMD模拟轨迹中的水分子取向的VMD脚本呢？我想画出一张这样的图：在类似附件中模式图的体系中，二维催化剂表面的水分子取向分布。谢谢各位！

回复 Reply

xyang 发表于 Post on 2026-3-31 22:18:23

[CP2K] 请问大家有没有统计AIMD模拟轨迹中的水分子取向的VMD脚本。你好这个问题解决了嘛？

粉川桜雪 发表于 Post on 2025-10-17 18:17:39

sobereva 发表于 2025-10-17 03:48
gromacs里有h2order命令可以借用

参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX ...

谢谢社长

sobereva 发表于 Post on 2025-10-17 03:48:57

gromacs里有h2order命令可以借用

参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX）幻灯片：

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