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ONIOM体系基于IRC结果优化中间体结构，但得到了接近产物结构

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本主题由 sobereva 于 2025-10-17 03:51 分类

gsd

发布时间: 2025-10-16 18:56

正文摘要:

本帖最后由 gsd 于 2025-10-16 19:12 编辑各位大佬，我在优化中间体结构（ONIOM体系）时遇到以下问题：计算的是一个P450酶环氧化双键的反应，预期氧自由基进攻双键后会形成一个自由基/碳正离子中间体；用g ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-10-17 03:54:06

1 绝对不能
2 如果用较小步长上限也优化不出来中间体，说明在当前级别的势能面上就是不存在中间体
3 “recorrect=never代替lqa，认为这比lqa更准确” 我持否定态度。这比用LQA更槽

lanthanum 发表于 Post on 2025-10-16 23:38:30

gsd 发表于 2025-10-16 20:33
是的，老师，MM部分是一整个蛋白，太大了图片不好放（开始接触时查的文献太少以为别人都做这么大的）；
...

（1）试试簇模型。
（2）怀疑电荷和/或自旋多重度有问题，请把输入文件上传吧。

gsd 发表于 Post on 2025-10-16 20:33:06

本帖最后由 gsd 于 2025-10-16 20:40 编辑

lanthanum 发表于 2025-10-16 19:14
截图只显示QM部分，MM部分隐藏了？整体是+1电荷，4重态吗？

是的，老师，MM部分是一整个蛋白，太大了图片不好放（开始接触时查的文献太少以为别人都做这么大的）；
整体+1个电荷，ONIOM高层电荷中和，净电荷为0，自旋多重度4，自旋多重度2下IRC只能跑3步，拿不到中间体结构，手动调整初猜也是直接优化到产物；
目前觉得这个中间体在自旋多重度4下优化出来的可能性大一点，所以先做了自旋多重度4。

lanthanum 发表于 Post on 2025-10-16 19:14:34

截图只显示QM部分，MM部分隐藏了？整体是+1电荷，4重态吗？

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