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强烈不建议用IGM,等值面很丑 我在Structure and Bonding. Springer, Berlin, Heidelberg. DOI: 10.1007/430_2025_95中提出的mIGM是好得多的选择,耗时跟IGM一样,看最新版Multiwfn手册3.23.10节的介绍和4.20.12节的例子 仔细检查Multiwfn里输入的原子序号(记得VMD里index从0而非从1开始),并且确认Multiwfn正确识别了所有元素(看载入文件后Multiwfn在窗口中明确显示的化学组成) |
| 谢谢您的指导 我后面也这样做了 但还是外相互作用时会显示C3H8上面的等值面 |
| 从VMD导出结构应当用选择语句排除四点水的虚拟位点MW、保留完整所有水分子(而不在边缘留一堆氢原子和羟基),这样multiwfn读取结构、构建准分子密度做IGM分析才合适。 |
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