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在berendsen压浴下出现警告不适用

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发布时间: 2025-10-29 21:15

正文摘要:

各位老师们,我在进行预平衡阶段采用了berendsen的压浴方法,但出现如下警告,目前暂时不打算用c-rescale的压浴,因为我模拟的几个体系均采用berendsen的方法且已经模拟完成,想追求一样的条件,想问问老师们我可以 ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-10-30 09:07:34
huangzi 发表于 2025-10-29 21:46
好的谢谢老师,我看到sob老师说c-rescale很理想、最普适,想问问老师假如我更换c-rescale,是可以直接一 ...

可以
如这页北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/KGMX)所示,全过程通用:

huangzi 发表于 Post on 2025-10-29 21:46:05
student0618 发表于 2025-10-29 21:27
实际上问题不大,但很可能被对理论很较真的审稿人批。

论坛有不少人问过,可参考sob老师的回答如http:// ...

好的谢谢老师,我看到sob老师说c-rescale很理想、最普适,想问问老师假如我更换c-rescale,是可以直接一直使用的吗?不像berendsen一样在平衡之后更换p-r压浴
student0618 发表于 Post on 2025-10-29 21:27:11
本帖最后由 student0618 于 2025-10-29 21:31 编辑

实际上问题不大,但很可能被对理论很较真的审稿人批。

论坛有不少人问过,可参考sob老师的回答如http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 0&fromuid=64740

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