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组内决定购买高性能计算机,主要用Gromacs(偶尔用量化)和分子对接,R语言,请教

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发布时间: 2025-10-31 16:16

正文摘要:

本帖最后由 AxiEJohn 于 2025-10-31 16:18 编辑 如题,组内决定购买高性能计算机,主要用Gromacs(偶尔用量化)和分子对接,R语言,向各位老师请教如下配置单是否可行? 配置模版来源社长的极高性能分子动力学服 ...

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fwz3888 发表于 Post on 2025-12-4 10:43:55
tonganlhy 发表于 2025-12-4 09:14
对,微星主板有优化,上四条内存可以跑在比较高的频率,其它主板一般都要降频很多

原来如此,感谢答疑
tonganlhy 发表于 Post on 2025-12-4 09:14:05
fwz3888 发表于 2025-12-3 16:01
请教一下,微星主板对四条内存有什么独特的优化吗?

对,微星主板有优化,上四条内存可以跑在比较高的频率,其它主板一般都要降频很多
fwz3888 发表于 Post on 2025-12-3 16:01:34
tonganlhy 发表于 2025-10-31 17:11
主板用不着那么好的,找个三大家的850就可以了。微星最好,以后可以四条内存。比如9950x3d+微星b850mortar  ...

请教一下,微星主板对四条内存有什么独特的优化吗?
AxiEJohn 发表于 Post on 2025-11-30 19:38:37
tonganlhy 发表于 2025-11-30 18:07
Kingston这种溢价很多的,国产的金白达和阿斯嘉特其实就够用了

好的,谢谢您,硬件购买方面笔者不太了解。这涨价实在夸张。
tonganlhy 发表于 Post on 2025-11-30 18:07:11

Kingston这种溢价很多的,国产的金白达和阿斯嘉特其实就够用了
Stardust0831 发表于 Post on 2025-11-4 20:24:29
lmch 发表于 2025-11-4 13:59
5090D相比5090性价比怎么就糟糕了?gmx计算速度的核心FP32算力又没砍,他这又不是做AI。现在v2 国内也就1 ...

我的表述里并没有说“5090D相比5090”,而是我的群友ア熵增焓减ウ的一些测试数据表明,“新的RTX卡用于科学计算的性价比都不高”。
lmch 发表于 Post on 2025-11-4 14:07:23
cpu 不用x3d ,显卡去淘宝,主板减配至 华硕TUF/微信迫击炮一级足矣,固态从PCI4.0随便找个中端就够,固态内存最近金子价,实在无力吐槽。
lmch 发表于 Post on 2025-11-4 13:59:19
Stardust0831 发表于 2025-11-3 22:20
5090D性价比比较糟糕了,买RTX的目的就是获得高性价比的支持CUDA13的GPU,非要RTX的话可以3080魔改20GB。最 ...

5090D相比5090性价比怎么就糟糕了?gmx计算速度的核心FP32算力又没砍,他这又不是做AI。现在v2 国内也就1w6。
AxiEJohn 发表于 Post on 2025-11-4 13:14:55
Stardust0831 发表于 2025-11-3 22:20
5090D性价比比较糟糕了,买RTX的目的就是获得高性价比的支持CUDA13的GPU,非要RTX的话可以3080魔改20GB。最 ...

谢谢您,提供了一个好思路,有空我看看“最新的CPU和软件栈搭配廉价而高效的旧时代GPU和高速网络”和直接用5090差别有多大。
Stardust0831 发表于 Post on 2025-11-3 22:20:25
5090D性价比比较糟糕了,买RTX的目的就是获得高性价比的支持CUDA13的GPU,非要RTX的话可以3080魔改20GB。最近买显卡的话V100很推荐,@Entropy.S.I 设计的千显卡集群就有一个9950X3D+四张V100的节点配置,这个千卡集群可以申请免费试用,我当时上去测了下跑gaussian和Gromacs都挺给力的。

最好找个地方测一下自己的算力需求究竟多高,如果发现日常显卡使用率不足30%的话没必要直接买硬件,可以等等最近贵的离谱的内存降价or换更低的配置。
AxiEJohn 发表于 Post on 2025-11-3 21:56:47
Voidmio 发表于 2025-11-3 19:54
玛雅,现在这内存价格

是啊,今个都3000了,忒贵。我看社长今年8月给出配置的“内存:2*金士顿FURY 32GB DDR5-5600  2*680”,才2*680
Voidmio 发表于 Post on 2025-11-3 19:54:32
玛雅,现在这内存价格
AxiEJohn 发表于 Post on 2025-10-31 17:56:26
tonganlhy 发表于 2025-10-31 17:11
主板用不着那么好的,找个三大家的850就可以了。微星最好,以后可以四条内存。比如9950x3d+微星b850mortar  ...

好的,谢谢您,我跟着优化一下,这样能便宜不少

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