如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “能量最小化问题” 改了，以后务必注意！

gmx trjconv -pbc mol
能解决的话这只影响显示。如果拓朴没问题的话，对模拟没影响。

student0618 发表于 2025-10-31 21:17
周期性边界先处理好。

请问我该如何处理呢

周期性边界先处理好。