关于Gromacs计算界面聚合问题分相的问题

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发布时间: 2025-11-15 16:20

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sobereva 发表于 Post on 2025-11-21 04:20:35

jiushizhege 发表于 2025-11-20 12:26
老师我对密度修改后，npt后仍然出现团聚，请问这是什么原因呢？这是因为力场的原因吗
建模

没模拟细节没法说
如果对两种分子的纯液体做NPT模拟密度都正常，说明不是力场的问题
力场、非键作用计算设置等方面没问题的情况下，模拟后不是处于均匀液体状态而是形成球形团簇，只可能是NVT模拟且模型中的密度偏低，或者NPT模拟的时候控压设置不当导致密度没法自发调节成实际情况

jiushizhege 发表于 Post on 2025-11-16 10:44:13

sobereva 发表于 2025-11-16 06:02
建模问题。初始结构里水的区域密度太低，导致水不够多

好的老师十分感谢您

sobereva 发表于 Post on 2025-11-16 06:02:12

建模问题。初始结构里水的区域密度太低，导致水不够多

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