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求助molclus做一个水凝胶和亚甲基蓝的构象搜索，结构都优化失败了

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moiraaa

发布时间: 2025-11-17 16:14

正文摘要:

各位老师好，我目前在做一个水凝胶（很大）（里面没有过渡金属）和亚甲基蓝的构象搜索，正在做高斯优化，但是结构都优化失败了，现在isomers.xyz里面是空白的，请问各位老师应该怎么办？

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moiraaa 发表于 Post on 2025-11-20 12:40:19

sobereva 发表于 2025-11-18 02:26
Molclus FAQ
http://sobereva.com/730（http://bbs.keinsci.com/thread-50349-1-1.html）
看Q9

好的，好的，谢谢社长

sobereva 发表于 Post on 2025-11-18 02:26:52

Molclus FAQ
http://sobereva.com/730（http://bbs.keinsci.com/thread-50349-1-1.html）
看Q9

没事甭用tight收敛限，既没必要、对柔性大体系又难达到，还明显更花时间。区区40轮迭代次数上限也根本不够
要结合被调用的程序的基本使用常识来使用molclus

KazusaT 发表于 Post on 2025-11-17 22:12:16

你的信息给的太模糊了
1. 你这个很大到底是多大啊，一两百原子？几百原子？上千原子？
2. 让molclus保留失败的文件备份，看看具体是为什么优化失败了
3. 既然体系很大、还写了opt=tight、还写了maxcyc=40，你是期望他在40轮优化中就达到tight收敛限吗。。。？

moiraaa 发表于 Post on 2025-11-17 21:55:53

sobereva 发表于 2025-11-17 19:06
认真看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html，尽快修改帖子标题，避免损害论坛形象。写一堆什么乱 ...

好的，社长，已经修改了，以后我会注意的

moiraaa 发表于 Post on 2025-11-17 21:55:18

snljty2 发表于 2025-11-17 16:28
1. 不要拍照，屏幕输出截屏即可，输入文件建议直接上传附件。
2. 按照论坛发帖时务必注意恰当填写标题要求 ...

好的好的，谢谢老师，已经重新修改了标题，同时之后我会先认真检查再发帖子，我已经重新计算了

sobereva 发表于 Post on 2025-11-17 19:06:29

认真看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html，尽快修改帖子标题，避免损害论坛形象。写一堆什么乱七八糟的
如果2天内标题没修改，将删帖扣分处理

snljty2 发表于 Post on 2025-11-17 16:28:42

1. 不要拍照，屏幕输出截屏即可，输入文件建议直接上传附件。
2. 按照论坛发帖时务必注意恰当填写标题要求正确填写标题。
3. 为什么要写两遍Title、电荷、自旋多重度和[GEOMETRY]？

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