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用orca_2mkl处理omol25数据库中的gbw文件出现问题

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发布时间: 2025-11-25 21:50

正文摘要:

本帖最后由 dfghjk 于 2025-11-26 10:49 编辑 最近刚接触orca,想要用orca_2mkl处理omol25数据库中数据的gbw文件(geom_orca6的geom_100004943_0_1,图上的是low_spin_23的),然后就报错gbw文件的版本太旧了。今天 ...

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zjxitcc 发表于 Post on 2025-11-26 14:48:40
完全没有必要重跑。搞清楚/问清楚对方使用具体哪一个ORCA版本做的计算,自己用对应版本的orca_2mkl就行了。
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-11-26 11:53:46
dfghjk 发表于 2025-11-26 10:53
谢谢,sob老师下面也说了去文章里找一找orca的版本,提到用的是6.0.0,我昨天用的6.1.0。再就是之前邮件 ...

这个链接是私密的不允许公开的吗?我看globus需要注册订阅才能访问,不像zenodo啊figshare啊github之类的开放下载,那我自然没法知道你看到的文件是什么样了。在hugging face放的应该是ai模型的检查点,不是训练集本身,我看错了。

话说下载该数据集是打算训练新的大模型么,这个数据规模哪怕是能顺利读取波函数文件也会花不少时间吧
dfghjk 发表于 Post on 2025-11-26 10:53:18
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-11-25 22:08
是从https://huggingface.co/facebook/OMol25/tree/main下载的数据集文件么?分享ORCA的.gbw文件就和分享Ga ...

谢谢,sob老师下面也说了去文章里找一找orca的版本,提到用的是6.0.0,我昨天用的6.1.0。再就是之前邮件联系数据库的负责人,给的我一个globus的链接,这个里面的内容和hugging face都是一样的吗
sobereva 发表于 Post on 2025-11-26 06:34:54
那叫molden文件不叫modern文件
这种事直接问数据库的维护者问用的是ORCA什么版本,或者找发表这个数据库的原文(包括补充材料)看是什么版本算的,没必要自己折腾。非要自己鼓捣,就把ORCA从4开始到目前最新版本每一个小版本都凑齐了挨个试
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-11-25 22:08:55
是从https://huggingface.co/facebook/OMol25/tree/main下载的数据集文件么?分享ORCA的.gbw文件就和分享Gaussian的.chk文件一样离谱,毕竟.gbw是ORCA私有二进制文件且不同版本对应不同格式,开发者在论坛表示过表示不希望用户乱碰.gbw文件,而应当用新版ORCA的json接口来导出导入波函数信息。
https://orcaforum.kofo.mpg.de/vi ... &hilit=gbw+json
https://orcaforum.kofo.mpg.de/vi ... &hilit=gbw+json
这么大的问题或许联系原文作者是最合适的,看论坛里有没有关系硬的大佬去沟通了……

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