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发布时间: 2025-11-26 16:05
正文摘要:本帖最后由 crush 于 2025-11-26 16:03 编辑 背景：量子化学小白，研究体系是蛋白+普通有机小分子动力学模拟，现在想做一下质量较好的小分子拓扑文件。 小分子电荷采用sob老师的RESP计算教程3.1，力场参考sob老 ... |
SharkYYX2025 发表于 2025-11-27 14:12 好的，谢谢您！我的就是普通有机小分子，看来B3LYP还是合适的 |
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优化用B3LYP或者WB97XD取决于分子具体结构。可以参考这个 谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的 http://sobereva.com/557 单个多巴胺的话，用B3LYP-D3BJ在当前合适 |
KazusaT 发表于 2025-11-26 22:26 哈哈谢谢，对我来说方法合理正确，多花一点时间也是值得的  |
sobereva 发表于 2025-11-27 03:56 好的，谢谢sob老师，那我就不加弥散了。 还有想问一下老师，在做opt+freq时，用 b3lyp 还是 rwb97xd 两个区别大吗，哪个方法更合适呢？ |
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你图1里6-311G**适合做opt freq，给Multiwfn算RESP电荷用略糙（基组档次偏低），这是为什么下文的脚本里算单点用的是def2-TZVP 计算RESP原子电荷的超级懒人脚本（一行命令就算出结果） http://sobereva.com/476（http://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html） 6-311++G(d,p)带弥散根本没必要，尤其是给氢加的弥散，完全浪费时间。例子文件里fchk是这个级别下产生的并不代表推荐所有情况都用这个，本来sobtop主页上也没推荐用这个基组。 |
| 你能接受浪费一部分时间的话就可以。 |
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