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求助:VASP建模一定要是周期性的吗,我在大盒子里建模进行结构优化和吸附能计算可以吗

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uft
发布时间: 2025-11-26 10:27

正文摘要:

我在VASP中结构优化和计算吸附能,这样建模正确吗,是不是上下左右真空层建高一点就可以

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zblxyrz 发表于 Post on 2025-12-4 00:37:42
如果不是周期性体系,边缘的结构有时候会出现预期之外的变化,而且你恐怕要用更多的时间去让边缘结构收敛优化,
Diotima 发表于 Post on 2025-11-27 11:46:47
uft 发表于 2025-11-26 10:55
好的谢谢,那这样的结构能算带隙吗,算出来准确吗

应该是只能算HOMO-LUMO Gap吧。
sobereva 发表于 Post on 2025-11-27 04:01:18
uft 发表于 2025-11-26 10:55
好的谢谢,那这样的结构能算带隙吗,算出来准确吗

都是孤立体系了,哪来的带隙
sobereva 发表于 Post on 2025-11-27 04:00:44
uft 发表于 2025-11-26 10:53
好的,谢谢,我的基底是单层石墨烯,主要是想看石墨烯上的羟基对吸附的影响

第一性原理程序算石墨烯吸附就老老实实用周期性模型
诸如下文这样截出来的簇模型只适合量子化学程序
18碳环(cyclo[18]carbon)与石墨烯的相互作用:基于簇模型的研究一例
http://sobereva.com/615http://bbs.keinsci.com/thread-25306-1-1.html

并且看上文的讨论,弄清楚即便用簇模型,石墨烯的尺寸也至少应该多大

石墨烯本身没有羟基。分清楚氧化石墨烯和石墨烯的差别。
白皛白 发表于 Post on 2025-11-26 14:51:21
uft 发表于 2025-11-26 10:55
好的谢谢,那这样的结构能算带隙吗,算出来准确吗

可以算,但GGA-PBE泛函常会低估带隙,如果是定性研究或许没问题,因为看的是带隙的变化趋势。但如果要与实验值做对比的话到时候可能需要考虑用metaGGA或者杂化泛函之类的。
uft 发表于 Post on 2025-11-26 10:55:16
白皛白 发表于 2025-11-26 10:46
VASP可以这样算,但要保证盒子足够大,不同周期之间需保持6~8埃的距离避免相互作用。不过盒子大了算的就会 ...

好的谢谢,那这样的结构能算带隙吗,算出来准确吗
uft 发表于 Post on 2025-11-26 10:53:37
wangnan2256 发表于 2025-11-26 10:38
不一定要是周期性,但是要避免相互作用,要留足够的距离,而且这个模型如果第一层是吸附分子,第二层是基底 ...

好的,谢谢,我的基底是单层石墨烯,主要是想看石墨烯上的羟基对吸附的影响
白皛白 发表于 Post on 2025-11-26 10:46:09
VASP可以这样算,但要保证盒子足够大,不同周期之间需保持6~8埃的距离避免相互作用。不过盒子大了算的就会慢很多,所以感觉这样的体系没理由用VASP,CP2K或高斯都算的比VASP快的多的多,结合multiwfn能做的性质计算也更丰富些。
wangnan2256 发表于 Post on 2025-11-26 10:38:55
不一定要是周期性,但是要避免相互作用,要留足够的距离,而且这个模型如果第一层是吸附分子,第二层是基底,基地就太小了。即便你这两层都是基底感觉也有点小了。另外你这个体系不算大,也不一定非要用vasp来做,gaussian也算的动。

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