Gaussian计算IRC后取端点优化，多个基元反应重合的中间体取什么能量

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发布时间: 2025-11-27 14:18

我研究的是一个酶的催化反应，有多个基元反应，其中我优化的过渡态2和过渡态3，都只有一个虚频，分别对两个过渡态走IRC，曲线都是平滑正常的，然后取IRC曲线的两个端点优化，并计算smd和sp，最后整合计算的能量取哪 ...

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dreamyeye 发表于 Post on 7 day ago

两个IM2如果能量相差这么大，应该不是同一构象，可能中间还有一步或者多步构象变化

dreamyeye 发表于 Post on 7 day ago

hopedream 发表于 2026-3-4 21:13
请教中间体是如何得到的？

过渡态做irc之后用一端的结构优化得到

hopedream 发表于 Post on 7 day ago

请教中间体是如何得到的？

Voidmio 发表于 Post on 2025-11-29 19:18:52

按理来说，你描述的这两个端点结构优化后应该是完全相同的，否则你凭什么能将之分别与两端用虚线连接起来？

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