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Gaussian报错l202两原子距离过近但找不到原子

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发布时间: 2025-11-27 19:08

正文摘要:

本帖最后由 zhaiyu 于 2025-11-27 19:25 编辑 由于之前都是算的小分子,对分子晶体这方面不是很了解,希望能解惑,感谢! 目前从分子晶体里解出来一个cif文件,利用MOMAP去计算转移积分,MOMAP也是调用的Gaussia ...

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wal 发表于 Post on 2025-11-27 20:48:54
zhaiyu 发表于 2025-11-27 20:39
好的谢谢。请问您是怎么发现原子叠一起了的,如果不从图片从log哪一部分可以看出来呢,直接从坐标看吗? ...

把log的坐标复制出来,或者直接把gjf头暂时删掉只留坐标,报错的是7,262你就看第7行和第262行的坐标是不是一样。
zhaiyu 发表于 Post on 2025-11-27 20:39:16
本帖最后由 zhaiyu 于 2025-11-27 20:42 编辑
wal 发表于 2025-11-27 19:46
我打开看了一眼,你原子叠一起了,一个位置显示两三个标号,那肯定看不清啊。是gjf设置的有问题。

好的谢谢。请问您是怎么发现原子叠一起了的,如果不从图片从log哪一部分可以看出来呢,直接从坐标看吗?我也是第一次碰到,想学习记录一下
wal 发表于 Post on 2025-11-27 19:46:29
zhaiyu 发表于 2025-11-27 19:28
好的,已修改,但发现log打开连原子编号都看不清

我打开看了一眼,你原子叠一起了,一个位置显示两三个标号,那肯定看不清啊。是gjf设置的有问题。
zhaiyu 发表于 Post on 2025-11-27 19:28:00
wal 发表于 2025-11-27 19:14
你应该上传的是log文件 转换的时候标号可能会变的

好的,已修改,但发现log打开连原子编号都看不清
wal 发表于 Post on 2025-11-27 19:14:19
你应该上传的是log文件 转换的时候标号可能会变的

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