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纯CPU做电解质溶液分子动力学,CP2K 和 GROMACS 哪个更合适?

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发布时间: 2025-12-6 18:24

正文摘要:

各位老师好,我最近有一个关于电解质溶液的小课题,需要进行分子动力学模拟,但本人完全是 MD 小白,目前在选择软件方面有些困惑,想向大家请教。我们课题组的服务器目前 没有 GPU 节点,只能使用纯 CPU 进行计算。 ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-12-6 19:08:04
GROMACS最适合。这么小的体系纯CPU跑也足够快了

CP2K跑AIMD适合的情况是:
想要比力场更高精度,或者检验力场的结果的合理性
没有合适力场的情况
涉及到成键断键

你的情况不属于以上任何一种。sobtop产生GAFF力场的拓扑文件结合RESP2(0.5)电荷,结合常用的SPC/E水模型,就可以跑得很好

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