Gromacs非标准氨基酸残基的蛋白MD建模：sobtop产生rtp文件

查看数: 904 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 13

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2025-12-8 20:43

本帖最后由 JohnCase 于 2025-12-18 16:38 编辑此教程用pymol编辑分子，multiwfn计算resp电荷，用sobtop产生.rtp文件，以及手写用于加氢的.hdb文件，可以让gmx pdb2gmx直接生成（稍加修改即可使用的）topol.top ...

回复 Reply

Myth 发表于 Post on 2026-1-6 10:43:35

感谢分享

谢文豪 发表于 Post on 2025-12-18 09:31:35

大赞楼主，第一次见到这么详细的流程贴

njust-lbc 发表于 Post on 2025-12-10 17:58:57

顶顶顶

JohnCase 发表于 Post on 2025-12-10 14:34:36

我要自己顶一下，我目前网上没搜到在rtp文件的路线上能走完全流程的其它帖子

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register