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求助沸石吸附金属团簇体系CI-NEB计算极慢,设置是否有问题?

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MVK
发布时间: 2025-12-9 11:34

正文摘要:

老师们好,我在用 CP2K(PBE-GD3BJ/DZVP-MOLOPT-SR-GTH、OT、64 核、mpirun -np 64)做沸石吸附金属合金团簇的 CI-NEB 任务,体系总共约600个原子,其中大部分是沸石框架的Si O原子,同样级别下体系本身做几何优化收 ...

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MVK 发表于 Post on 2025-12-9 19:55:44
sobereva 发表于 2025-12-9 16:43
不要乱用xtb这个词,认真看下文“搞清楚xtb和GFN-xTB是什么” 部分
计算化学中的一些常见不良写法和用词 ...

抱歉老师已修改qwq
sobereva 发表于 Post on 2025-12-9 16:43:15
MVK 发表于 2025-12-9 14:51
谢谢sob老师 这个ddl只有一周了 我姑且直接用xtb跑了

不要乱用xtb这个词,认真看下文“搞清楚xtb和GFN-xTB是什么” 部分
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html
MVK 发表于 Post on 2025-12-9 14:51:25
本帖最后由 MVK 于 2025-12-9 19:55 编辑
sobereva 发表于 2025-12-9 14:16
改成NPROC_REP=4,让所有16个NEB image同时跑
NEB耗时显然比几何优化高一个数量级,得跑那么多image。如果 ...

谢谢sob老师 这个ddl只有一周了 我姑且直接用GFN1-xTB跑了
sobereva 发表于 Post on 2025-12-9 14:16:36
改成NPROC_REP=4,让所有16个NEB image同时跑
NEB耗时显然比几何优化高一个数量级,得跑那么多image。如果参加过北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP),把里面“过渡态搜索与反应路径的产生”那一节讲的NEB原理和CP2K的NEB相关的计算机制好好复习复习,讲得极其深入、全面、清楚。
workflow可以尝试。PBE-GD3BJ/ZVP-MOLOPT-SR-GTH必须写成PBE-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH,注意书写的严谨

MVK 发表于 Post on 2025-12-9 11:47:44
老师们还有个问题,我发现用GFN1-xTB进行CI-NEB任务的时候会因为SCF不收敛导致任务终止(底物产物结构是已经用PBE优化过的),请问针对CI-NEB任务可以开启IGNORE_CONVERGENCE_FAILURE吗

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