请教5个羧酸盐位点+Ln³⁺体系构建与Ln³⁺选择性机理解释

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发布时间: 2025-12-15 11:04

各位老师好，我目前正在以一个已知的蛋白质和LA离子的结构为模板，选择了LA离子周围配位的5个氨基酸和3个水分子进行体系构建，参考教程使用Gaussian做镧系金属配合物的量子化学计算 - 思想家公社的门口：量子化学· ...

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YuniJ 发表于 Post on 2025-12-16 09:54:24

sobereva 发表于 2025-12-16 00:39
1.1 可以
1.2 更远距离的残基会从弱相互作用层面产生影响，但如果当前的选择性来自于化学键作用，保留更远 ...

好嘞老师！谢谢老师！

sobereva 发表于 Post on 2025-12-16 00:39:59

1.1 可以
1.2 更远距离的残基会从弱相互作用层面产生影响，但如果当前的选择性来自于化学键作用，保留更远的不太必要
1.3 只保留与LA的作用有密切关系的水，其它的用隐式溶剂模型表现

2.1 对比与不同离子的结合自由能的差异

3.1 该是几就设成几，甭管gview的判断

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