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求助：gmx rdf计算出来曲线随着x不断增大

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1601452201

发布时间: 2025-12-15 22:18

正文摘要:

本帖最后由 1601452201 于 2025-12-16 09:39 编辑想请问下大家，正常的rdf一般都会收敛到1这个特定值，我在用gmx rdf计算过后，得到的曲线如图所示，所使用的指令为gmx rdf -f NVT.xtc -s NVT.tpr -n N.ndx -o R ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-12-17 02:23:49

1601452201 发表于 2025-12-16 08:54
感谢社长，计算的体系是HOF离子过膜选择性的一个过程，在自由扩散下，HOF种的N原子和溶液中跨膜金属离子 ...

如果金属离子是嵌在固定的膜里面的，算这种rdf并没什么意义，说明不了什么

1601452201 发表于 Post on 2025-12-16 08:54:28

sobereva 发表于 2025-12-16 00:06
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚、完整
http://sobereva.com/620（h ...

感谢社长，计算的体系是HOF离子过膜选择性的一个过程，在自由扩散下，HOF种的N原子和溶液中跨膜金属离子之间的RDF。

sobereva 发表于 Post on 2025-12-16 00:06:20

在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚、完整
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）
详细交代算的体系、组

应根据rdf的物理定义理解、解释曲线特征。要搞清楚很多情况会收敛到1的本质原因是什么，别光看表象、误以为无论什么情况都应该收敛到1

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