关于Martini CG pH模型建模的问题

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发布时间: 2025-12-16 16:22

本帖最后由 LucasYan 于 2025-12-18 11:08 编辑各位大佬好，我想做不同pH条件下的CG模型建模，现在用Martini进行膜蛋白的构建，从蛋白pdb-->CG pdb,后用insane插入DPPC中，生成的molecule_0.itp是滴定前的蛋 ...

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LucasYan 发表于 Post on 2026-2-27 20:32:27

那年冬天风在吹发表于 2026-1-23 16:33
请问你解决了吗？我也遇到这个问题，maritini官网那个教程也是给出的都是例子里滴定后的分子的itp，但是怎 ...

是的，主要是我要做的蛋白体系酸滴定，怎么生成的酸滴定itp没有人讲，不能自己生成了，只能用生成好的

那年冬天风在吹 发表于 Post on 2026-1-23 16:33:16

请问你解决了吗？我也遇到这个问题，maritini官网那个教程也是给出的都是例子里滴定后的分子的itp，但是怎么得到这个滴定后分子的itp缺没有讲，那这样根本就没法用

LucasYan 发表于 Post on 2025-12-18 11:06:05

student0618 发表于 2025-12-16 23:01
看原文有没有给，方法有没有文档。

已上传原文以及通讯作者给的文件包括一份tutorial

student0618 发表于 Post on 2025-12-16 23:01:20

看原文有没有给，方法有没有文档。

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