student0618 发表于 2025-12-16 22:00
检查轨迹，分子在入口出口有什么相互作用、离开出口后是否远离蛋白等 ； 检查Histogram是否足够重叠。

感谢回复！在后面几个windows分子离开出口后已经远离了蛋白，histogram都有重叠（部分windows没有达到50%重叠，我再试试补充一下）。请问相互作用是提取某几帧的构象做分析么？还是有什么计算工具可以实现呀？

检查轨迹，分子在入口出口有什么相互作用、离开出口后是否远离蛋白等 ； 检查Histogram是否足够重叠。