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粗粒化模拟十二烷密度偏大的问题2

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zhangfaxue

发布时间: 2025-12-22 16:09

正文摘要:

继之前的帖子（粗粒化模拟十二烷密度偏大的问题 http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 6&fromuid=55969 (出处: 计算化学公社) ）请教各位之后，对体系做了简化只有油相，盒子尺寸80埃*80埃*80埃，放了1355个十 ...

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zhangfaxue 发表于 Post on 2025-12-24 09:33:07

lmch 发表于 2025-12-23 22:06
用autoff简要测试了一次，C12密度 826.140259 kg/m3@ 293K+1bar (exp: 749.55) 对应珠子参数的质量是~57 ...

请问cg是什么？第二个测试是粗粒化吗，方便请教一下力场参数如何设置的吗

lmch 发表于 Post on 2025-12-23 22:06:02

本帖最后由 lmch 于 2025-12-23 22:48 编辑

用autoff简要测试了一次，C12密度 826.140259 kg/m3@ 293K+1bar (exp: 749.55) 对应珠子参数的质量是~57。

mdp临时套用全原子的。

更新：用了cg的mdp C12密度 774.904 kg/m3@ 293K+1bar 大概满足标准。

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