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“cp2k能不能直接兼容VASP的输出文件CONTCAR呀” 毫无意义,毫无必要,凭什么要兼容,这又不是什么流行、普适、众所周知的主流格式,昂贵的VA$P更不是什么必用的程序 “一直转换文件格式好麻烦” 有什么麻烦的?诸如常见的cif文件转成xyz,用Multiwfn载入cif后输入xyz再输入要产生的xyz文件路径,立马就得到了,有什么麻烦的。restart文件(如几何优化任务得到、并作为NEB始末点的结构)也是可以直接这么靠Multiwfn瞬间转成xyz文件。北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)里极度全面系统讲CP2K做NEB的各种例子里都充分体现了。非要莫名其妙多一步鼓捣VASP的文件绕弯路才是真正的自找麻烦。 |
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1. 这里的设置的插点数目就包含始末结构,没啥不好理解的。你提供的结构数目少于插点数目时程序会自动帮你插值。OPTIMIZE_END_POINTS 已经设置为了F,就代表对始末结构不做优化。如果你的始末态是没有经过优化的,把这个选项设置为T就能在算NEB的过程中同时优化始末结构。 2. 结构文件指哪个?restart文件还是xyz,没必要删除,文件体积又不大,占不了多少存储空间。 3. 续算直接提交CONTCAR-1.restart计算就行,后续产生的文件命名会改为-1_1-n.XXX,不存在文件覆盖问题。每一个CONTCAR-1_n.restart代表每进行一次NEB计算后产生的续算文件,其中的最新一步restart的文件内容和CONTCAR-1.restart是一样的。 4. 为什么需要转化为CONTCAR呢,有啥使用的必要么 |
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